Réseau des expertises Grenobloise autour du calcul scientifique

 

 

L'idée est de mettre en place dans le cadre de CIMENT/MaiMoSiNE un réseau "calcul scientifique" Grenoblois constitué essentiellement d'ingénieurs, de post-doctorants et de chercheurs travaillant dans le domaine du calcul scientifique et du HPC autour de la modélisation.

 

Il s'agit de fédérer les expertises souvent complémentaires, d'informer sur des manifestations liés au calcul et au HPC, de permettre à chaque membre de profiter d'expériences locales, de partager une expertise sur un même projet, de façon plus brève, de ne pas travailler tout seul dans son coin...

 

1. Une mailing-list a été créée: calcul.maimosine@imag.fr  , vous pouvez vous abonner à l'adresse http://listes.imag.fr/wws/info/calcul.maimosine
2. Un séminaire autour du calcul et du HPC avec des expériences locales et la possibilité de dialoguer sur ces expériences.
   
   Pour consulter ou récupérer les slides des séminaires du réseau calcul
    
3. Les sites Grenoblois:

 

• Méso-centre (CIMENT)

 

• LJK : Laboratoire Jean Kuntzmann

 

• OSUG : Observatoire de Grenoble
  • IPAG : Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble (ex-LAOG et ex-LPG)
  • ISTerre : Institut des Sciences de la Terre (ex-LGIT et ex-LGCA)
  • SCCI : Service Commun de Calcul Intensif de l'Observatoire.
  • LEGI : Laboratoire des Ecoulement Géophysiques et Industriels.
  • LGGE : Laboratoire de Glaciologie et de Géophysique de l'Environnement.
  • LTHE : Laboratoire d'Etude des Transferts en Hydrologie et Environnement.
• Institut Néel de Grenoble

 

Méso-Centre

Deux ingénieurs de recherche aux interfaces du Méso-Centre et des activités de modélisation sur Grenoble et en Rhône-Alpes

 

• Bruno Bzeznik

 

Ingénieur de Recherche, coordonne en collaboration avec les responsables techniques des pôles  de CIMENT, les implémentations sur l'ensemble du réseau.

1. Domaine(s) d'applications:  informatique distribuée, grappes et grilles de calcul et de stockage

2. Implémentation informatique: configuration et installation des machines de calcul, développement de la grille CiGri, du gestionnaire de ressources OAR et de la gestion du stockage distribué.

 

• Laurence Viry

 

Ingénieur de Recherche, interface entre MaiMoSINE et le méso-centre  CIMENT, chargée de la diffusion de l'expertise en calcul scientifique, HPC et méthodes numériques.

1. Domaine(s) d'applications: Géophysique, mécanique des fluides, physiques des particules.

2. Modélisation mathématiques: Méthodes de couplage, décomposition de domaines, analyse de sensibilité, quantification d'incertitudes.

3. Implémentation informatique: Fortran95/2003, C++, python, R, programmation parallèle (OpenMP, MPI, ...), outils d'aide au développement.

 

LJK

 

Cellule Calcul Scientifique du LJK:

Deux ingénieurs de recherche en collaboration avec l'équipe système du LJK.

 

• Stéphane Despréaux:

1. Domaine(s) d'applications: fiabilité, N-Corps, graphes dynamiques, cryptographie, geometrie 2D (splines), 3D

2. Modélisation mathématiques: outils mathématiques: algèbre lineaire, optimisation (BFGS, Simplex, algorithme génétique), EDO, EDP

3. Implémentation informatique: méthodologie UML, langages :C++, Java, librairies: Qt, java3D, vtk, clapack, ogdf, boost

 

• Franck Pérignon:

1. Domaine(s) d'applications: modélisation et simulation de systèmes dynamiques non réguliers (applications en mécanique, pb de contact-frottement, électronique, robotique), mécanique des fluides et structures, vibrations non linéaires.

2. Modélisation mathématiques: méthodes particulaires, éléments finis, différences finis, analyse convexe, inclusions différentielles,  problème de complémentarité.

3. Implémentation informatique: C++ (stl, boost ...),  python, fortran, bibliothèques d'algèbres linéaires (blas et cie), MPI, programmation sur GPU (démarrage...), matlab

4. Environnements et outils de développement: administration d'outils de gestion de projet (fusionforge -> forge.imag.fr),  gestionnaire de source (svn, git), cmake, autotools, uml, packaging (python, cpack ...), doxygen, php

 

Chercheurs/Doctorants et posts doctorants  LJK

 

• Christophe.Picard

1. Domaine(s) d'applications: mécanique des fluides, Fluides complexes

2. Modélisation mathématiques: Différences Finis, Volumes Finis et Elements finis

3. Implémentation informatique: C++, Fortran, Python, OpenMPI, OpenCL, CUDA, HPC

 

• Jérome Lelong

1. Domaine(s) d'applications: les probabilités numériques et en particulier la finance

2. Modélisation mathématiques: EDP et méthodes de Monte Carlo adaptative

3. Implémentation informatique: C/C++, MPI (et OpenMP) pour la partie parallèle. Mes codes utilisent la librairie PNL que je développe également (http://www-ljk.imag.fr/membres/Jerome.Lelong/soft/pnl). Je m'intéresse avant tout à la mise au point d'algorithmes parallèles pour des architectures de type cluster pas grille.

 

• Franck Vigilant

1. Domaine(s) d'applications: Océanographie, météorologie, thermique, mécanique des fluides

2. Modélisation mathématiques: méthodes variationnelles appliquées à l'assimilation de données, matrices sparses, résolution de systèmes raides.

3. Implémentation informatique: matlab, scilab, Fortran, C, python, MPI

 

 

OSUG

 

SCCI: Service Commun de Calcul Intensif de l' Observatoire

 

• Françoise Roch

 

Directrice Technique SCCI

1. Domaine(s) d'applications: Sciences de l'Univers

2. Modélisation mathématiques:

3. Implémentation informatique: Fortran, C, OpenMP, HPC, programmation sur multicoeurs

 

• Emmanuel Chaljub

 

Physicien ISTerre, Directeur Scientifique SCCI, responsable méso-centre CIMENT

1. Domaine(s) d'applications: sismologie, risque sismique, sismologie globale, elastodynamique, gravito-Èlastodynamique, couplage solide-fluide.

2. Modélisation mathématiques: formulation variationnelle, éléments finis, éléments spectraux, méthode des joints, différences finies.

3. Implémentation informatique: programmation parallèle, décomposition de domaines, maillage.

 

• IPAG: Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble

 

• ISTerre : Institut des Sciences de la Terre

 

 

• LEGI: Océanographie, équipe MEOM

 

• Jean-Marc Molines: équipe MEOM

1. Domaine(s) d'applications: modélisation océanique à multi-échelles, régionales et globales, dans le cadre de recherches sur le climat et en amont de l'océanographie opérationnelle.

2. Modélisation mathématiques: utilisation de modèles mathématique construit autour de NEMO ( Nucleus for European Modelisation of the Ocean ). Modèle en différences finies, parallèle et vectoriel.

3. Implémentation informatique: Implémenté  en fortran90 et parallelisé avec MPI, en décomposition de domaine.  Run de productions réalisés essentiellement sur les gros calculateurs de GENCI (IDRIS, CINES) sur plusieurs centaines, voire milliers de coeurs.  Développement et maintenance d'outils de diagnostic/visualisation  pour l'exploitation des résultats de ces modèles. Outils partagés dans une large communauté fédérée dans le consortium DRAKKAR.

 

• Jean-Michel Brackart

Responsable du développement, de la maintenance et de l'exploitation des outils d'assimilation de donnéesde l'équipe MEOM du LEGI.

1. Domaine(s) d'applications: océanographie

2. Modélisation mathématiques: modèles de circulation générale, d'écosystème,...

3. Implémentation informatique: logiciel d'assimilation de données SESAM

 

• Patrick Begou

Ingénieur de recherche en informatique au LEGI, équipe MOST

1. Domaine(s) d'applications: mécanique des fluides, simulation et modélisation des écoulements turbulents instationnaires tridimensionnels.

2. Modélisation mathématiques: utilisation de modèles sous-maille, adaptation aux géométries complexes (maillage non structurés) et aux écoulements complexes (multiphasiques, avec réactions chimiques, avec combustion etc...). Résolution des équations de Navier-Stokes, compressibles ou incompressibles, avec des schémas aux différences finies d'ordres élevés et/ou des méthodes pseudospectrales...

3. Implémentation informatique: utilisation de codes communautaires comme OpenFoam ou issus de collaborations (Trio_U avec le CEA, Yales avec le CORIA, NGA avec le CTR...etc). Langages Fortran90, C++. Expérience en parallélisation et vectorisation (openmp, MPI, PVM) sur Cray T3D/T3E du CEA et de l'Idris et, plus récement, sur les IBM Regatta et Blue-GeneP de l'IDRIS. Orientation vers les GPGPUs. Utilisation des outils de visualisation paraview et AVS.

 

• LGGE: Laboratoire de Glaciologie et de Géophysique de l'Environnement

 

• LTHE: Laboratoire d'Etude des Transferts en Hydrologie et Environnement

 

• LECA: Laboratoire d'Ecologie Alpine

 

• Institut Néel de Grenoble

 

• Dan-Gabriel Calagaru

1. Domaine(s) d'applications: Géophysique (étude des précurseurs sismiques, mécanismes o-sismiques, exploitation pétrolière), Santé (écoulement sanguin, transport d'oxygène, athérosclérose)

2. Modélisation mathématiques: schémas de discrétisation numérique des EDP, algorithmes de couplage, décomposition de domaine, problèmes 
   inverses

3. Implémentation informatique: fortran 77/90, C, Tcl/Tk, MPI, Eclipse, Rocks (clustering)

 

À terme ces informations figureront dans la base de données des expertises qui pourra être consultée sur le site MaiMoSiNE.